Il sonar a scansione laterale (side scan sonar) è lo strumento più adatto per ottenere la caratterizzazione morfologica dei fondali marini: per i rilievi morfologici di precisione la Coral Reef utilizza side scan sonar (SSS) digitale ad alta risoluzione che, convertendo echi sonori (secondo il principio del sonar) in impulsi luminosi in uno schermo oscilloscopico, fornisce immagini del fondo marino e di oggetti sommersi (relitti, tubazioni, reperti, altro).
Lo strumento è collegato con un computer sul quale è installato il software per l’acquisizione ed il processing digitale dei dati. In fase di restituzione, il software consente l’elaborazione del mosaico completo dell’area indagata.
Per ottenere un elevato grado di precisione nel posizionamento, il software d’acquisizione è interfacciato al sistema di navigazione.